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背景
最近,由于某些原因,特別關注了醫療知識圖譜方面的發展&應用情況,有了些淺薄認識,故碼此文,以供參考。
隨著智能時代的到來,把臨床數據、臨床指南、組學數據通過大數據、知識圖譜、可視化系統結合,核心醫學概念的全面覆蓋、醫療生態圈內全方位知識數據的聚合,構建綜合醫療大腦,給臨床醫生、科研工作者、管理工作者提供幫助,成為未來醫療的發展方向。
Tips:
臨床數據:醫院信息系統的電子病歷、影像、檢驗等一大堆專業臨床業務系統產生的數據集合。
臨床指南:針對特定的臨床情況,幫助臨床醫生和患者根據特定的臨床情況做出恰當決策的指導意見。
組學數據:如基因組學、蛋白組學及代謝組學產生的生物信息數據,醫院另一個數據中心。
想法
既然是綜合的醫療大腦,那么滿足多樣化的應用場景是必要條件,提供語義搜索、知識問答、臨床輔助、疾病趨勢預測、疾病易感人群、熱詞搜索標簽云、預防、疾病所需檢查、忌吃食物、理療食譜等等。從大量的醫療新聞、臨床指南,醫院歷史數據,藥品庫、疾病庫、處方庫、風險因子庫和醫療資源庫,建立起實體之間的語義關系,最后形成知識圖譜、醫學大腦、成為社會化醫療應用。
以美團餐飲大腦為參考,構建綜合性醫學大腦,邀請更多醫療機構參與合作,共同構建完整的醫學大腦,包括疾病癥狀、用藥參考、以及從海量病例中挖掘的經驗知識等等,以疾病、癥狀、用藥、問診等節點,建立精準的關系結構,實現智能化的診療知識圖譜。如果單純按照臨床數據、臨床指南、組學數據等數據圖譜化沒有太大的發展意義。如CMeKG中文醫學知識圖譜,屬學術研究不做過多評價。
CMeKG目前是1.0版,包括:6310種疾病、19853種藥物(西藥、中成藥、中草藥)、1237種診療技術及設備的結構化知識描述,涵蓋疾病的臨床癥狀、發病部位、 藥物治療、手術治療、鑒別診斷、影像學檢查、高危因素、傳播途徑、多發群體、就診科室等以及藥物的成分、適應癥、用法用量、有效期、禁忌證等30余種常見關系類型, 關聯到的醫學實體達20余萬,CMeKG目前的概念關系實例及屬性三元組達100余萬。CMeKG僅供學術研究使用,不做商業用途。
行業難點
醫療、金融等細分領域的智能化過程中,行業本身面臨著諸多困境,醫惠科技何國平講到了醫療行業的四座大山:
針對以上問題,我在調研過程中發現OMAHA七巧板醫學術語集文檔,只不過加入使用需要支付昂貴的費用,這里我列出一些官方提供的文檔作為參考:
1、OMAHA七巧板醫學術語集入門指南.pdf
2、OMAHA術語集發布文件規范.pdf
3、子集定制工具使用指南.pdf
以前由專家收集整理信息的建設方式消耗巨大的資金與時間,至今仍沒有一個較為完整的醫學知識圖譜。中文醫學術語建設更是嚴重落后于發達國家,嚴重醫療大數據技術的發展。